台湾的鱼类，由于各种原因对生态平衡的破坏，有一些已成为珍稀鱼类。如特有的“樱花钩吻鲑”，又名“台湾鳟”，在雪霸公园七家湾溪仅存2000余条（一说仅700条）。这种鱼俗名“梨山鳟”。这种鱼的最大特征是：体侧有9个椭圆形云斑，体长在10-20厘米。生活在摄氏16度以下水中。这种鱼在溪流中产卵，幼鱼游到大海，长成成鱼，到产卵期回到溪中进行排卵。但是，随着溪流因各种原因被石块阻塞，鱼无法回到海中，因此影响了它的正常繁衍。现在七家湾溪建立了樱花钩吻鲑人工培育中心进行人工繁衍和饲养。同时当地采取了严格保护措施。对游人进行必要的限制。
在河里山达那伊谷溪流中有“高山鲴鱼”被当地列为禁渔区，从而使一度濒临灭绝的高山鲴鱼，得以繁衍。宜兰福山植物园中的池水里的1米左右长的台湾马口鱼，同样是珍品。其它如只食水藻的“苦花鱼”，则不需破膛即可烹食或晾干储存食用。
福山区南势溪流水域的香鱼和鳟鱼，以及海中的鳗鲶、石舻、粗皮、石斑、塞鲷、板机[鱼屯]等都是台湾的名贵鱼类。
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