赤潮藻类急剧增殖，大量消耗海洋中的营养盐，当水中营养盐耗尽时，赤潮藻类不能生长，并开始大量死亡，海水中的细菌对其进行耗氧分解，消耗海水中的大量溶解氧，能使几百甚至上千平方公里的海域形成缺氧或厌氧环境，造成鱼类栖息地的仔幼鱼、无脊椎动物及养殖水生动物窒息死亡。
赤潮对渔业危害事件，国内国外都有发生，仅举国内几例。
1.1980~1986年间，在香港海域发生赤潮致死鱼类事件12次，造成养殖鱼类死890吨，直接经济损失490万港元。
2.1952年黄河口海区由夜光藻引起的赤潮，使海水发臭，重达1.5~2千克的梭鱼，3~4千克的鲈鱼和免鱼大批死亡，漂浮海面。
3.1972年8~11月，在东海北部海域由三种束毛藻引起的赤潮，赤潮区域内，海水发臭、发粘，呈现棕黄色，涉及四个渔区，2000平方公里海域渔船无法生产，鱼类大批死亡。
4.1977年8月，在天津大沽口一带，由微型原甲藻形成的赤潮，海水呈红褐色，涉及范围5600平方公里，水质发臭，滞留20天之久，海面漂浮大量死鱼，赤潮区内张网作业无鱼可获。
5.1989年8~9月，渤海湾河北黄骅沿岸海域发生大面积赤潮，涉及沿海7个县市，有10万亩虾池减产上万吨，造成经济损失2亿元；天津市沿海也受赤潮影响，经济损失4360万元；山东莱州湾海域出现大面积赤潮20万亩虾池受灾，海洋捕捞、贝类大幅度减产，经济损失上亿元。
二、原因
1.赤潮发生高密度的聚集繁殖，死亡分解造成水体大面积缺氧致死鱼贝类。
2.高密度赤潮生物堵塞鱼鳃，使鱼类窒息死亡。
3.赤潮生物有毒性，使鱼类吞食后直接中毒死亡。
4.赤潮生物大批死亡后，分解物具有较强毒性，可直接毒死鱼贝类。
5.赤潮发生后引起细菌繁殖以及恶化水质产生硫化氢等，硫化氢对鱼类有毒害作用。
三、赤潮严重影响海钓
发生赤潮海域，赤潮生物大量繁殖，吸收水中营养盐类，赤潮生物大批死亡，消耗水质溶氧，产生大量二氧化碳和硫化氢等，使上千平方公里海域形成一个缺氧海区，使海水发臭，海洋鱼虾贝无法生存，大批鱼类死亡，此时在这种水环境无法海钓，这期间海洋生物及鱼类的生存都将受到严重威胁，就别说鱼会摄食咬钩了。如果想要海钓，笔者认为就要远离赤潮区，或到有流水进入的河口附近，垂钓海淡两水鱼，否则鱼获甚微。
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